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在生物制药过程中，蛋白质的回收是一个重要的环节。而传统的回收流程包括沉淀、离心、层析等方法，但这些回收方法存在着效率低、成本高，还有操作复杂等问题。随着膜分离技术的发展成熟，越来越多的研究表明膜分离技术对蛋白回收有广泛应用前景。
 
一、膜分离回收菌体蛋白
发酵液在发酵中会产生产品、副产品、残留物、菌体等液体物质。膜分离技术可以有效回收活菌和菌体蛋白。根据菌种大小等条件，可以选择合适的膜，最终实现膜分离技术的高效应用。
 
二、膜分离技术在豆制品上的回收
生产都豆乳时会产生大豆乳清，一般的分离回收方法只能从中提取60%的蛋白质，但用超滤膜设备分离，可以增加豆腐的收得率，并且还可以去除豆膻味以及去除影响豆乳稳定性的低分子物质，从而提高豆乳的质量。
膜分离还能净化废液，保护环境。用膜分离技术能从大豆中提取大豆异黄酮、低聚糖、免疫球蛋白、竹叶黄酮等一些有效功能物质。
 
三、膜分离技术在淀粉工业应用
膜分离技术会根据蛋白分子和其他物质的分子量不同，将淀粉蛋白废水经过膜过滤，回收淀粉废水中的蛋白，同时其他物质经过膜过滤，也能得到回收利用。膜分离技术降低了损耗，提高了效率，还维护了生态平衡和环境。